केवल जीवित प्रोबायोटिक्स लेने से लक्षित स्वास्थ्य लाभ प्राप्त हो सकते हैं, लेकिन समय के साथ, उत्पाद में जीवित बैक्टीरिया की संख्या कम हो जाएगी क्योंकि कोशिकाएं स्वाभाविक रूप से मर जाती हैं। इसलिए, उत्पाद पर अंकित कॉलोनी बनाने वाली इकाइयां (सीएफयू) कॉलोनी बनाने वाली इकाइयां (सीएफयू) होनी चाहिए जो "शेल्फ लाइफ" तक जीवित रहती हैं, न कि उत्पादन के दिन व्यवहार्य बैक्टीरिया की संख्या, क्योंकि उत्पादन दिन और के बीच शेल्फ जीवन की समाप्ति तिथि, बैक्टीरिया की संख्या कम होने की संभावना है।
हालाँकि, उच्चतर कॉलोनी-गठन इकाइयाँ (सीएफयू) का मतलब बेहतर परिणाम नहीं है। सही दृष्टिकोण उन प्रोबायोटिक उत्पादों को चुनना है जिनमें सीएफयू स्तर होते हैं जो वांछित प्रभावकारिता के साथ चिकित्सकीय रूप से सिद्ध हो चुके हैं।
यदि शरीर बहुत अधिक प्रोबायोटिक्स लेता है, तो यह आसानी से आंतों के वनस्पतियों में असंतुलन पैदा कर सकता है, जो शरीर के स्वास्थ्य के लिए अच्छा नहीं है। एक ओर, शरीर निर्भर हो जाएगा: प्रोबायोटिक्स एक प्रकार का आंतों का वनस्पति है जो आंतों के वनस्पतियों के संतुलन को बहाल करने में मदद कर सकता है, जिससे शुष्क मल और अत्यधिक मल आवृत्ति जैसे असहज लक्षणों में सुधार होता है। हालाँकि, यदि आप लंबे समय तक अत्यधिक मात्रा में प्रोबायोटिक्स का सेवन करते हैं, तो उन पर निर्भर होना आसान है। एक बार जब आप इन्हें लेना बंद कर देते हैं, तो आपको अपच, शौच में कठिनाई और अन्य असुविधाएँ हो सकती हैं, जो आपके स्वास्थ्य के लिए अच्छा नहीं है; दूसरी ओर, इससे आंतों की वनस्पतियों में असंतुलन हो सकता है: हर किसी के शरीर में आंतों की वनस्पतियां संतुलित होती हैं। यदि आप बहुत अधिक प्रोबायोटिक्स लेते हैं, तो इससे आंतों में प्रोबायोटिक्स की अधिकता हो जाएगी, जिससे आंतों के वनस्पतियों में असंतुलन, दस्त, पेट दर्द आदि हो सकता है, जो शरीर के आंतों के स्वास्थ्य को प्रभावित करेगा; कुछ अन्य स्थितियाँ भी हैं: पेप्टिक ट्रैक्ट अल्सर और गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल रक्तस्राव वाले रोगियों के लिए, प्रोबायोटिक्स के अत्यधिक सेवन से बैक्टीरिया अल्सर से रक्तप्रवाह में प्रवेश कर सकते हैं, जिससे बैक्टीरिया उत्पन्न होता है और चक्कर आना, बुखार और अन्य असुविधाएँ होती हैं, जो शरीर के स्वास्थ्य को प्रभावित करती हैं।
प्रोबायोटिक उत्पादों का चयन करते समय, आपको अपनी व्यक्तिगत आवश्यकताओं और स्वास्थ्य स्थितियों के आधार पर उचित प्रकार और जीवित जीवाणुओं की संख्या का चयन करना चाहिए।